小樽市には消化器内科のある医療機関が17件あります。うち日曜診療0件、夜間対応（19時以降）0件、オンライン診療対応2件。条件で絞り込み、おすすめ順に掲載しています（厚生労働省オープンデータ・2025年12月1日時点）。
病院 ／ 北海道小樽市銭函３丁目２９８番地
診療所 ／ 北海道小樽市稲穂２丁目１９番１３号
病院 ／ 北海道小樽市新光１丁目２１番５号
病院 ／ 北海道小樽市潮見台１丁目５番３号
病院 ／ 北海道小樽市稲穂１丁目９番２号
病院 ／ 北海道小樽市新光２丁目２９番３号
病院 ／ 北海道小樽市築港 １０番 １号
病院 ／ 北海道小樽市住ノ江１丁目６番１５号
病院 ／ 北海道小樽市稲穂１丁目４番１号
病院 ／ 北海道小樽市稲穂２丁目２２番６号
診療所 ／ 北海道小樽市花園３丁目１５－１５花園内科クリニック
診療所 ／ 北海道小樽市花園２丁目５番４号
診療所 ／ 北海道小樽市塩谷２－１７－１３
診療所 ／ 北海道小樽市稲穂３－１－１７
診療所 ／ 北海道小樽市奥沢２－６－１２
診療所 ／ 北海道小樽市桜２丁目２５番１９号
診療所 ／ 北海道小樽市入船１－８－１５